安徽醫(yī)科大學(xué)前身是上海東南醫(yī)學(xué)院，創(chuàng)辦于1926年5月，1949年底響應(yīng)*華東局“面向農(nóng)村，走向內(nèi)地”的號(hào)召，內(nèi)遷安徽省懷遠(yuǎn)縣，成為安徽省第一所高等醫(yī)科院校。1952 年遷至省會(huì)合肥市現(xiàn)址，改名為安徽醫(yī)學(xué)院。1996年6月經(jīng)國(guó)家教委批準(zhǔn)，更名為安徽醫(yī)科大學(xué)。學(xué)校占地約86萬(wàn)平方米（1296 畝），建筑總面積約70余萬(wàn)平方米。建校以來(lái)，共為社會(huì)培養(yǎng)醫(yī)學(xué)人才38000余人。 學(xué)校堅(jiān)持規(guī)模、結(jié)構(gòu)、質(zhì)量、效益協(xié)調(diào)發(fā)展，辦學(xué)水平不斷攀升。學(xué)校的辦學(xué)定位是建設(shè)特色鮮明、國(guó)內(nèi)先進(jìn)水平的教學(xué)研究型醫(yī)科大學(xué)。2006年10月，學(xué)校成功地舉辦了以“人文、學(xué)術(shù)、創(chuàng)新”為主題的80周年校慶，成立校董事會(huì)和校友聯(lián)誼會(huì)。學(xué)校將現(xiàn)代著名教育家蔡元培先生專門(mén)為學(xué)校前身東南醫(yī)學(xué)院畢業(yè)生的題詞“好學(xué)力行，造就良醫(yī)”，確立為新校訓(xùn)。
